weighted by Eisenberg hydrophobicity scale value

Russian translation: см.

13:55 Mar 25, 2016
English to Russian translations [PRO]
Science - Biology (-tech,-chem,micro-)
English term or phrase: weighted by Eisenberg hydrophobicity scale value
The sequence-based HI was calculated as described in the Exemplary Methods section, below, and is based on the relative ratio of hydrophobic to hydrophilic amino acids, where ""each amino acid is weighted by its Eisenberg hydrophobicity scale value"". The structure-based Hydrophobicity Index is calculated similarly, except that the SASA determined from the structure is included in the calculation for each amino acid. The index is defined as:

HI (structure) = ∑ (SiEi/SjEj)
where i represents the hydrophobic amino acids, i.e., A, F, I, L, V, W, Y and j represents the hydrophilic amino acids, i.e., D, E, G, H, K, M, N, Q, R, S, T. (For key to 1-letter identifying abbreviations for amino acids, see Table 1, below in text.)

где показетель гидрофобности каждой аминокислоты взвешивается по значениям гидрофобности по шкале Эйзенберга&
Спасибо!
dao2812
Russian translation:см.
Explanation:
"где значение SAS для каждой аминокислоты умножено (взвешено) на значение ее значение гидрофобности по шкале ОМН (шкала Свита-Эйзенберга)".
"взвешенный" в данном контексте означает "умноженный"

--------------------------------------------------
Note added at 18 hrs (2016-03-26 08:11:33 GMT)
--------------------------------------------------

Хорошо, что такое S в приведенной формуле? В первом приведенном фрагменте написано буквально следующее "где каждая аминокислота взвешена на ее значение гидрофобности по шкале Айзенберга". Вообще говоря, я не понимаю, что значит "каждая ам-та взвешена" на к-л. значений. Очевидно, что "взвешено" значение некоторой характеристики ам-ты. Судя по тому, что эта характеристика обозначена как S - я принял ее за SAS, что имеет смысл. Сейчас посмотрел - да это так
"S is the SASA value and E is the Eisenberg scale value of each amino acid".
Теперь про термин "взвешенное" значение. Я использовал термин "умножение", глядя на формулу, поскольку ничего кроме такового в ней не увидел. Формула выглядит несколько странно, из нее совершенно непонятно, как проводится суммирование (часть индексов явно пропущена, часть не на своем месте).
Про "взвешенное" - посмотрите что такое "средневзвешенное значение"
https://ru.wikipedia.org/wiki/Среднее_арифметическое_взвешен...
т.е. можно, конечно, предположить , что в шкале Айзенберга сумма всех значений ам-т приравнивается к 1, т.е. индивидуальное значение для каждой ам-ты по этой шкале есть число в диапазоне от 0 до 1, а если сложить все эти значения для отдельных ам-т, то сумма д.б.=1. Но повторюсь - в авторском определении (формуле) не понятно как проводится суммирование. Выглядит так, что авторы сами не совсем понимают смысл того, о чем написали. Так, кстати, было и в случае с шенноновской энтропией, та формула, что приведена в патенте не совпаадает с оригиналом в статье.
Selected response from:

Marlin31
Russian Federation
Local time: 01:24
Grading comment
Спасибо!
4 KudoZ points were awarded for this answer



Summary of answers provided
4представлена значением гидрофобности по шкале Эйзенберга
Margarita Vidkovskaia
3см.
Marlin31


Discussion entries: 2





  

Answers


2 hrs   confidence: Answerer confidence 4/5Answerer confidence 4/5
weighted by eisenberg hydrophobicity scale value
представлена значением гидрофобности по шкале Эйзенберга


Explanation:
...HI was calculated as described in the Exemplary Methods section, below, and is based on the relative ratio of hydrophobic to hydrophilic amino acids, where each amino acid is weighted by its Eisenberg hydrophobicity scale value.
...HI был рассчитан согласно описанию в разделе... далее и основан на показателе отношения гидрофобных и гидрофильных аминокислот, где каждая аминокислота представлена соответствующим значением гидрофобности по шкале Эйзенберга.

Margarita Vidkovskaia
Russian Federation
Local time: 01:24
Specializes in field
Native speaker of: Native in RussianRussian
PRO pts in category: 300
Login to enter a peer comment (or grade)

42 mins   confidence: Answerer confidence 3/5Answerer confidence 3/5
weighted by eisenberg hydrophobicity scale value
см.


Explanation:
"где значение SAS для каждой аминокислоты умножено (взвешено) на значение ее значение гидрофобности по шкале ОМН (шкала Свита-Эйзенберга)".
"взвешенный" в данном контексте означает "умноженный"

--------------------------------------------------
Note added at 18 hrs (2016-03-26 08:11:33 GMT)
--------------------------------------------------

Хорошо, что такое S в приведенной формуле? В первом приведенном фрагменте написано буквально следующее "где каждая аминокислота взвешена на ее значение гидрофобности по шкале Айзенберга". Вообще говоря, я не понимаю, что значит "каждая ам-та взвешена" на к-л. значений. Очевидно, что "взвешено" значение некоторой характеристики ам-ты. Судя по тому, что эта характеристика обозначена как S - я принял ее за SAS, что имеет смысл. Сейчас посмотрел - да это так
"S is the SASA value and E is the Eisenberg scale value of each amino acid".
Теперь про термин "взвешенное" значение. Я использовал термин "умножение", глядя на формулу, поскольку ничего кроме такового в ней не увидел. Формула выглядит несколько странно, из нее совершенно непонятно, как проводится суммирование (часть индексов явно пропущена, часть не на своем месте).
Про "взвешенное" - посмотрите что такое "средневзвешенное значение"
https://ru.wikipedia.org/wiki/Среднее_арифметическое_взвешен...
т.е. можно, конечно, предположить , что в шкале Айзенберга сумма всех значений ам-т приравнивается к 1, т.е. индивидуальное значение для каждой ам-ты по этой шкале есть число в диапазоне от 0 до 1, а если сложить все эти значения для отдельных ам-т, то сумма д.б.=1. Но повторюсь - в авторском определении (формуле) не понятно как проводится суммирование. Выглядит так, что авторы сами не совсем понимают смысл того, о чем написали. Так, кстати, было и в случае с шенноновской энтропией, та формула, что приведена в патенте не совпаадает с оригиналом в статье.

Marlin31
Russian Federation
Local time: 01:24
Specializes in field
Native speaker of: Native in RussianRussian
PRO pts in category: 262
Grading comment
Спасибо!
Notes to answerer
Asker: В первом предложении нет SAS: The sequence-based HI was calculated as described in the Exemplary Methods section, below, and is based on the relative ratio of hydrophobic to hydrophilic amino acids, where ""each amino acid is weighted by its Eisenberg hydrophobicity scale value"".

Asker: во втором на этом контекст: The structure-based Hydrophobicity Index is calculated similarly, except that the SASA determined from the structure ""is included"" in the calculation for each amino acid.

Login to enter a peer comment (or grade)



Login or register (free and only takes a few minutes) to participate in this question.

You will also have access to many other tools and opportunities designed for those who have language-related jobs (or are passionate about them). Participation is free and the site has a strict confidentiality policy.

KudoZ™ translation help

The KudoZ network provides a framework for translators and others to assist each other with translations or explanations of terms and short phrases.


See also:
Term search
  • All of ProZ.com
  • Term search
  • Jobs
  • Forums
  • Multiple search